截至2023年底，全球共享流感數(shù)據(jù)倡議組織（GISAID）已收錄超過(guò)1500萬(wàn)條新冠病毒基因組序列，其中涵蓋了從阿爾法到奧密克戎及其眾多亞分支的演變軌跡。這些海量數(shù)據(jù)背后，一個(gè)核心問(wèn)題浮出水面：面對(duì)不斷“換馬甲”的病毒，我們當(dāng)下的檢測(cè)技術(shù)，新冠病毒變異株能測(cè)出來(lái)嗎？ 答案是明確且肯定的。不僅能測(cè)，精準(zhǔn)識(shí)別變異株還是我們制定治療方案和防控策略的基石。

簡(jiǎn)單說(shuō)，能測(cè)出來(lái)嗎？答案是肯定的！

直接告訴你，能。而且必須能。這不是一個(gè)“能不能”的問(wèn)題，而是一個(gè)“用哪種方法測(cè)”和“測(cè)得多精細(xì)”的問(wèn)題。就像找人，你可以知道小區(qū)里來(lái)了個(gè)陌生人（核酸檢測(cè)陽(yáng)性），也可以精確知道他的姓名、身份證號(hào)和老家在哪（基因測(cè)序確定變異株類(lèi)型）。臨床和公共衛(wèi)生對(duì)病毒監(jiān)控的需求是分層的，我們的檢測(cè)技術(shù)也相應(yīng)地提供了不同“分辨率”的答案。所以，下次你再想“新冠病毒變異株能測(cè)出來(lái)嗎”，可以放心，專(zhuān)業(yè)的病原微生物檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室有足夠的工具來(lái)應(yīng)對(duì)。

怎么測(cè)？3種主流方法大比拼

目前，實(shí)驗(yàn)室里主要靠三招來(lái)“鎖定”變異株，它們各有各的用處。

第一招，也是大家最熟悉的核酸檢測(cè)（RT-PCR）。它就像個(gè)高度靈敏的“警報(bào)器”，通過(guò)檢測(cè)病毒基因組中特定的片段來(lái)判斷“有沒(méi)有病毒”。一些經(jīng)過(guò)特殊設(shè)計(jì)的核酸檢測(cè)，還能玩點(diǎn)“花樣”——比如突變特異性PCR。它在引物設(shè)計(jì)上動(dòng)了手腳，讓檢測(cè)只能對(duì)特定的關(guān)鍵突變位點(diǎn)起反應(yīng)。如果樣本里有這個(gè)突變，信號(hào)就強(qiáng)；沒(méi)有，信號(hào)就弱甚至沒(méi)有。這種方法速度快、成本相對(duì)低，適合對(duì)某些已知的重要變異（比如奧密克戎的S基因缺失）進(jìn)行快速篩查。但它有個(gè)局限：它只能告訴你它設(shè)計(jì)好的那個(gè)突變?cè)诓辉冢瑢?duì)于沒(méi)設(shè)計(jì)進(jìn)去的新突變或者全基因組信息，它就無(wú)能為力了。

第二招，基因測(cè)序，這是當(dāng)前鑒定變異株的“金標(biāo)準(zhǔn)”。它可不是只盯著幾個(gè)位點(diǎn)看，而是要把病毒基因組整個(gè)兒“讀”一遍，通常能覆蓋99%以上的序列。拿到完整的基因組序列后，科研人員會(huì)把它和參考毒株（比如最早的武漢株）進(jìn)行比對(duì)，每一個(gè)堿基的差異都無(wú)所遁形。這樣，不僅能確認(rèn)它是阿爾法、德?tīng)査€是奧密克戎，還能精細(xì)區(qū)分出奧密克戎旗下的BA.5、BF.7、XBB等各類(lèi)亞分支。測(cè)序結(jié)果直接上傳數(shù)據(jù)庫(kù)，能為全球病毒演化追蹤提供最核心的數(shù)據(jù)。當(dāng)然，它的技術(shù)要求高、耗時(shí)更長(zhǎng)、成本也上去了。

第三招，在一些研究或特定場(chǎng)景下，還會(huì)用到基因芯片或高通量突變掃描技術(shù)。它們有點(diǎn)像“多位點(diǎn)同步快檢”，能同時(shí)檢測(cè)成百上千個(gè)已知的突變位點(diǎn)，速度比測(cè)序快，信息量比普通PCR大，算是個(gè)不錯(cuò)的折中方案。

核酸檢測(cè)，為啥有時(shí)“測(cè)不出”變異株？

這里有個(gè)常見(jiàn)的誤解需要澄清。很多人拿著核酸檢測(cè)陽(yáng)性報(bào)告問(wèn)：這能看出是哪種變異株嗎？通常，普通的核酸檢測(cè)報(bào)告是看不出的。它的設(shè)計(jì)目標(biāo)很單純：確認(rèn)感染。它的引物探針靶向的是病毒基因組中高度保守的區(qū)域（就是不太容易變的地方），這樣才能保證無(wú)論病毒怎么變異，基本都能被逮到。所以，一份“陽(yáng)性”報(bào)告，恰恰說(shuō)明檢測(cè)成功了，它檢測(cè)的是病毒的“共性”，而不是“個(gè)性”。它回答了“有沒(méi)有感染”的問(wèn)題，但沒(méi)有回答“感染的是哪一款”的問(wèn)題。要把具體的變異株揪出來(lái)，就得靠上面提到的后兩種方法了。

基因測(cè)序：揪出變異株的“金標(biāo)準(zhǔn)”

如果說(shuō)核酸檢測(cè)是“抓到了嫌疑人”，那基因測(cè)序就是“完成全套身份鑒定和指紋比對(duì)”。在湘雅醫(yī)院的檢測(cè)平臺(tái)上，我們對(duì)部分臨床樣本，尤其是重癥、疑難或需要流行病學(xué)調(diào)查的病例，會(huì)開(kāi)展病毒基因組測(cè)序。這個(gè)過(guò)程就像拼圖：先把病毒RNA反轉(zhuǎn)錄成DNA，打成無(wú)數(shù)隨機(jī)片段，然后用測(cè)序儀海量讀取這些片段的序列，最后通過(guò)生物信息學(xué)分析，把它們重新拼接成完整的基因組圖譜。這張圖譜和原始毒株一對(duì)比，哪里發(fā)生了突變（比如S蛋白上的關(guān)鍵位點(diǎn)），一目了然。新冠病毒變異株能測(cè)出來(lái)嗎？ 對(duì)于基因測(cè)序而言，這根本不是問(wèn)題。它不僅能測(cè)出來(lái)，還能告訴你它所有的變異細(xì)節(jié)，為理解病毒的傳播力、免疫逃逸能力和致病性變化提供最直接的證據(jù)。

測(cè)出來(lái)有啥用？對(duì)治療和用藥太關(guān)鍵了！

費(fèi)這么大勁測(cè)出變異株，可不是為了滿(mǎn)足好奇心。它的臨床和公共衛(wèi)生價(jià)值太大了。

對(duì)醫(yī)生來(lái)說(shuō)，知道具體的變異株類(lèi)型，有時(shí)能直接影響治療決策。比如，某些單克隆抗體藥物對(duì)早期的變異株效果很好，但對(duì)奧密克戎系列可能就完全失效了。如果檢測(cè)明確是奧密克戎感染，醫(yī)生就會(huì)避免使用這些無(wú)效的藥物，轉(zhuǎn)而選擇其他更可靠的治療方案，比如小分子抗病毒藥。這不只是省錢(qián)，更是對(duì)患者負(fù)責(zé)。

對(duì)公共衛(wèi)生體系而言，變異株監(jiān)測(cè)是疫情的“預(yù)警雷達(dá)”。通過(guò)持續(xù)監(jiān)測(cè)，我們能及時(shí)發(fā)現(xiàn)具有潛在威脅的新變異（比如傳播更快、免疫逃逸更強(qiáng)的），評(píng)估其風(fēng)險(xiǎn)，為調(diào)整疫苗策略、加強(qiáng)邊境檢疫、啟動(dòng)特定防控措施贏(yíng)得寶貴時(shí)間。沒(méi)有精準(zhǔn)的檢測(cè)，我們就是在“盲人摸象”。

報(bào)告怎么看？關(guān)注這幾個(gè)關(guān)鍵信息點(diǎn)

如果你或家人拿到了一份包含變異株信息的檢測(cè)報(bào)告，該怎么看？別被那些字母數(shù)字組合嚇到。

首先找變異株命名，比如“Omicron BA.5”、“XBB.1.16”等，這是它的“家族姓氏”和“分支代號(hào)”。其次，可以關(guān)注報(bào)告里是否提到了關(guān)鍵的突變位點(diǎn)，特別是S蛋白（刺突蛋白）上的突變，像R346T、F486P這些，這些位點(diǎn)常常和免疫逃逸能力增強(qiáng)有關(guān)。最后，看看測(cè)序覆蓋度和數(shù)據(jù)質(zhì)量，這能反映結(jié)果的可靠性。一份高質(zhì)量的測(cè)序報(bào)告，覆蓋度通常很高，能讓你對(duì)感染的病毒有非常清晰的畫(huà)像。

檢測(cè)有局限？這幾點(diǎn)你得心里有數(shù)

再好的技術(shù)也有邊界。了解局限，才能更好地理解結(jié)果。

第一，樣本要求高。測(cè)序需要樣本中有足夠量的、質(zhì)量好的病毒核酸。如果患者病毒載量很低，或者樣本保存運(yùn)輸不當(dāng)導(dǎo)致RNA降解，就可能測(cè)不出或測(cè)不全。第二，存在時(shí)間差。從采樣到出測(cè)序報(bào)告，需要數(shù)天甚至更長(zhǎng)時(shí)間，它更多用于回顧性分析和宏觀(guān)監(jiān)測(cè)，很難像核酸檢測(cè)那樣用于急診的快速診斷。第三，技術(shù)解讀的復(fù)雜性。測(cè)序會(huì)產(chǎn)生海量數(shù)據(jù)，其生物信息學(xué)分析需要專(zhuān)業(yè)人員和數(shù)據(jù)庫(kù)支持。一個(gè)新出現(xiàn)的、尚未被命名的變異，可能需要時(shí)間進(jìn)行國(guó)際共同研判。

總結(jié)與建議：給公眾和臨床醫(yī)生的幾點(diǎn)貼心話(huà)

聊了這么多，其實(shí)就想告訴大家，面對(duì)不斷變化的病毒，現(xiàn)代病原微生物檢測(cè)技術(shù)是我們手中最可靠的“偵察兵”。新冠病毒變異株能測(cè)出來(lái)嗎？ 我們已經(jīng)有了成熟、可靠的答案。

對(duì)于公眾，不必為“測(cè)不出變異株”而焦慮。常規(guī)核酸檢測(cè)的陰性或陽(yáng)性結(jié)果，依然是指導(dǎo)個(gè)人防護(hù)和就醫(yī)的核心依據(jù)。理解變異株檢測(cè)的意義，能幫助我們更好地配合公共衛(wèi)生政策，比如理解疫苗更新的必要性。

對(duì)于臨床醫(yī)生，尤其是在一線(xiàn)工作的同仁，我的建議是：在診治重癥、復(fù)雜或免疫缺陷患者時(shí)，如果有條件，可以積極考慮送檢病毒基因組測(cè)序。這份報(bào)告提供的精準(zhǔn)信息，或許就能為破解治療困境打開(kāi)一扇窗。同時(shí)，多關(guān)注本地疾控部門(mén)發(fā)布的變異株流行情況報(bào)告，它能幫你對(duì)當(dāng)前流行的病毒特性有個(gè)預(yù)判。

病毒的變異不會(huì)停止，我們的監(jiān)測(cè)網(wǎng)絡(luò)和檢測(cè)技術(shù)也必須保持敏銳和進(jìn)化。相信科學(xué)，善用工具，我們才能在每一次與病原體的交鋒中，贏(yíng)得更多的主動(dòng)。

周鑫 主治醫(yī)師

? 中南大學(xué)湘雅醫(yī)院 · 血液內(nèi)科